科林-Colin 科林-Colin
3年前
GO富集分析
  GO的主要用途之一是对基因组进行富集分析。例如,给定一组在特定条件下上调的基因,富集分析将使用该基因组的注释发现哪些GO术语被过度表示(或未充分表示)。  富集分析工具                用户可以直接从GOC网站的主页进行浓
Stella981 Stella981
3年前
R 包 pathview 代谢通路可视化
pathviewR包是一个集成pathway通路数据与可视化的工具集。它用于把用户的数据映射并渲染到相关的pathway通路图上,用户只需要提供基因或者化合物数据(geneorcompounddata)并指定目标通路(specifythetargetpathway)即可。pathview会产生nativeKEGGv
Stella981 Stella981
3年前
Hi
欢迎关注”生信修炼手册”!HiC技术的出现和发展掀起了三维基因组学研究的浪潮,该技术通量高,一次建库即可在全基因组范围内研究染色质三维空间结构,已经染色体空间互作关系,有助于更深层次地挖掘和了解基因的调控关系,本文整理了HiC数据分析相关的资料。首先是该领域的一些基本概念chromosometerr
Stella981 Stella981
3年前
CNV数据分析专题
欢迎关注”生信修炼手册”!CNV全称为CopyNumberVariatiosn,即拷贝数异常,是广泛存在于基因组上的一种结构变异现象。异常片段大小从1Kb到数Mb范围不等,包括了拷贝数的缺失、插入、重组以及多位点的复杂变异等多种情况。作为结构变异的一种,科学家自然而然将CNV和疾病联系起来,有很多的研究表明了CNV和疾病的关联性
Wesley13 Wesley13
3年前
R 语言绘制环状热图
作者:佳名来源:简书R语言文集1\.读取并处理基因表达数据这是我的基因表达量数据:!(https://oscimg.oschina.net/oscnet/505049817d7347a7acffef1befd7f67d.png"图Fig1
Wesley13 Wesley13
3年前
R 语言代写绘制功能富集泡泡图
功能富集泡泡图功能富集分析用来展示某一组基因(一般是单个样品上调或下调的基因)倾向参与哪些功能调控通路,对从整体理解变化了的基因的功能和潜在的调控意义具有指导作用,也是文章发表中一个有意义的美图。通常会用柱状图、泡泡图和热图进行展示。热图的画法之前已经介绍过,这次介绍下富集分析泡泡图,其展示的信息是最为全面的,也是比较抓人眼球的。做基因功能富集分
Stella981 Stella981
3年前
DevOps:从「蒸汽时代」到「高铁时代」,SUNMI DevOps转型之路
商米科技成立于2013年,总部位于上海市杨浦区创智天地,是一家极具产品创新基因和互联网基因的公司。商米在短时间内迅速成长为一家近1000人的企业,产品研发人数占比一度超过70%。做为一家初创企业,商米研发团队早期也经历过与当下大部分创业公司一样困境:协作基本靠吼、发布基本靠手的阶段。然而,业务的快速发展,团队规模不断的扩大,给商米带来了在「团队协作」
Python进阶者 Python进阶者
2年前
麻烦问一下算出来后怎么写成一个csv并有标题?
大家好,我是皮皮。一、前言前几天在Python铂金交流群【红色基因代代传】问了一个Pandas处理的问题,提问截图如下:!(https://uploadimages.jianshu.io/upload_images/2623978
流浪剑客 流浪剑客
1年前
SnapGene 5 for Mac激活版 附 激活补丁 及完整安装教程
是一款强大的分子生物学软件,专为Mac操作系统设计。它主要用于帮助科研人员快速绘制DNA序列、基因组结构和其他生物分子的结构,适用于在科学实验室、生物技术公司和医学研究机构等领域使用。SnapGene5forMac具有以下主要功能和特点:DNA序列绘制:S