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Hi-C技术的出现和发展掀起了三维基因组学研究的浪潮,该技术通量高,一次建库即可在全基因组范围内研究染色质三维空间结构,已经染色体空间互作关系,有助于更深层次地挖掘和了解基因的调控关系,本文整理了Hi-C数据分析相关的资料。
首先是该领域的一些基本概念
接下来是数据分析软件的各种操作
其中Hi-C数据的可视化是核心的一项分析内容
Hi-C数据分析结果的核心就是染色体互作强度的矩阵,目前也有很多公共数据库,存储了染色质互作的信息
除了分析染色体质互作外,Hi-C数据也可以辅助基因组组装
相对其他组学的数据分析,Hi-C数据分析的软件并没有什么特殊的地方,其难点在于数据量庞大,要求硬件资源很大。普通电脑无法胜任Hi-C数据的分析,必须要借助高性能计算机才行。
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