欢迎关注”生信修炼手册”!HiC技术的出现和发展掀起了三维基因组学研究的浪潮，该技术通量高，一次建库即可在全基因组范围内研究染色质三维空间结构，已经染色体空间互作关系，有助于更深层次地挖掘和了解基因的调控关系，本文整理了HiC数据分析相关的资料。首先是该领域的一些基本概念chromosometerr

功能富集泡泡图功能富集分析用来展示某一组基因(一般是单个样品上调或下调的基因)倾向参与哪些功能调控通路，对从整体理解变化了的基因的功能和潜在的调控意义具有指导作用，也是文章发表中一个有意义的美图。通常会用柱状图、泡泡图和热图进行展示。热图的画法之前已经介绍过，这次介绍下富集分析泡泡图,其展示的信息是最为全面的，也是比较抓人眼球的。做基因功能富集分

pathway建立在ko数据库的基础上，基于我们对生命活动中的分子相互作用和化学物质的反应的认识，构建了复杂的调控网络，采用通路图的形式，进行展示。通路图中融合了ko,module,compound,reaction，disease,drug等数据库中的信息，所以必须先理解了上面的几个数据库，才能对pathway有一个更直观的认识。

视频 https://www.bilibili.com/video/av7973580?fromsearch&seid16993146754254492690教材 _Molecularbiologyofthe gene_ 7thedition J.D.Watsonet.al转录的调控原核生物的转录调控

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