http://www.sohu.com/a/319918959\_278730
http://www.dxy.cn/bbs/thread/34987035?sf=2&dn=4#34987035
https://www.sohu.com/a/201713697\_301099
https://zhuanlan.zhihu.com/p/21258579
TBtools、heml、PermutMatrixEN、SPSS、origin
PermutMatrixEN进行双向聚类,而且可以图形最优化排列,很方便看出热点关系,SPSS不能进行最优可视化
heml:
https://www.plob.org/article/8465.html/comment-page-1/#comments
TBTOOLS:
https://www.omicshare.com/forum/thread-1062-1-1.html
http://www.sohu.com/a/328823607\_278730
PermutMatrixEN:
EuPathDomains: The Divergent Domain DataBase for Eukaryotic Pathogens
http://www.atgc-montpellier.fr/EuPathDomains/
origin
http://www.360doc.com/content/18/0504/20/42030643\_751167302.shtml
数据的归一化
Origin 对数据Standardize的方式采用z-score标准化,即将数据与平均数(本文为每行数据的平均数)相减再除以标准差(本文为每行数据的平标准差)的过程。用公式表示为:z=(x-μ)/σ。这样做的目的是将大于平均数的数“转化”为较小的正数,小于平均数的数“转化”为较小的负数。当然这不需要我们手动去计算。